第Ⅰ部分  Hadoop基礎(chǔ)知識(shí)

第1章  初識(shí)Hadoop 3

1.1  數(shù)據(jù)！數(shù)據(jù)！ 3

1.2  數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)與分析 5

1.3  查詢所有數(shù)據(jù) 6

1.4  不僅僅是批處理 7

1.5  相較于其他系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì) 8

1.5.1  關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng) 8

1.5.2  網(wǎng)格計(jì)算 10

1.5.3  志愿計(jì)算 11

1.6  Apache Hadoop發(fā)展簡(jiǎn)史 12

1.7  本書包含的內(nèi)容 16

第2章  關(guān)于MapReduce 19

2.1  氣象數(shù)據(jù)集 19

2.2  使用Unix工具來分析數(shù)據(jù) 21

2.3  使用Hadoop來分析數(shù)據(jù) 22

2.3.1  map和reduce 23

2.3.2  Java MapReduce 24

2.4  橫向擴(kuò)展 31

2.4.1  數(shù)據(jù)流 31

2.4.2  combiner函數(shù) 35

2.4.3  運(yùn)行分布式的
MapReduce作業(yè) 37

2.5  Hadoop Streaming 37

2.5.1  Ruby版本 38

2.5.2  Python版本 40

第3章  Hadoop分布式文件系統(tǒng) 42

3.1  HDFS的設(shè)計(jì) 42

3.2  HDFS的概念 44

3.2.1  數(shù)據(jù)塊 44

3.2.2  namenode和datanode 45

3.2.3  塊緩存 46

3.2.4  聯(lián)邦HDFS 47

3.2.5  HDFS的高可用性 47

3.3  命令行接口 50

3.4  Hadoop文件系統(tǒng) 52

3.5  Java接口 56

3.5.1  從Hadoop URL讀取
數(shù)據(jù) 56

3.5.2  通過FileSystem API
讀取數(shù)據(jù) 58

3.5.3  寫入數(shù)據(jù) 61

3.5.4  目錄 63

3.5.5  查詢文件系統(tǒng) 63

3.5.6  刪除數(shù)據(jù) 68

3.6  數(shù)據(jù)流 68

3.6.1  剖析文件讀取 68

3.6.2  剖析文件寫入 71

3.6.3  一致模型 74

3.7  通過distcp并行復(fù)制 76

第4章  關(guān)于YARN 78

4.1  剖析YARN應(yīng)用運(yùn)行機(jī)制 79

4.1.1  資源請(qǐng)求 80

4.1.2  應(yīng)用生命期 81

4.1.3  構(gòu)建YARN應(yīng)用 81

4.2  YARN與MapReduce 1相比 82

4.3  YARN中的調(diào)度 85

4.3.1  調(diào)度選項(xiàng) 85

4.3.2  容量調(diào)度器配置 87

4.3.3  公平調(diào)度器配置 89

4.3.5  延遲調(diào)度 93

4.3.5  主導(dǎo)資源公平性 94

4.4  延伸閱讀 95

第5章  Hadoop的I/O操作 96

5.1  數(shù)據(jù)完整性 96

5.1.1  HDFS的數(shù)據(jù)完整性 97

5.1.2  LocalFileSystem 98

5.1.3  ChecksumFileSystem 98

5.2  壓縮 99

5.2.1  codec 100

5.2.2  壓縮和輸入分片 105

5.2.3  在MapReduce中使用
壓縮 106

5.3  序列化 109

5.3.1  Writable接口 110

5.3.2  Writable類 112

5.3.3  實(shí)現(xiàn)定制的Writable
集合 121

5.3.4  序列化框架 125

5.4  基于文件的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 127

5.4.1  關(guān)于SequenceFile 127

5.4.2  關(guān)于MapFile 135

5.4.3  其他文件格式和
面向列的格式 136

第Ⅱ部分  關(guān)于MapReduce

第6章  MapReduce應(yīng)用開發(fā) 141

6.1  用于配置的API 142

6.1.1  資源合并 143

6.1.2  變量擴(kuò)展 144

6.2  配置開發(fā)環(huán)境 144

6.2.1  管理配置 146

6.2.2  輔助類GenericOptionsParser，
Tool和ToolRunner 149

6.3  用MRUnit來寫單元測(cè)試 152

6.3.1  關(guān)于Mapper 152

6.3.2  關(guān)于Reducer 156

6.4  本地運(yùn)行測(cè)試數(shù)據(jù) 156

6.4.1  在本地作業(yè)運(yùn)行器上
運(yùn)行作業(yè) 156

6.4.2  測(cè)試驅(qū)動(dòng)程序 158

6.5  在集群上運(yùn)行 160

6.5.1  打包作業(yè) 160

6.5.2  啟動(dòng)作業(yè) 162

6.5.3  MapReduce的Web
界面 165

6.5.4  獲取結(jié)果 167

6.5.5  作業(yè)調(diào)試 168

6.5.6  Hadoop日志 171

6.5.7  遠(yuǎn)程調(diào)試 173

6.6  作業(yè)調(diào)優(yōu) 174

6.7  MapReduce的工作流 176

6.7.1  將問題分解成
MapReduce作業(yè) 177

6.7.2  關(guān)于JobControl 178

6.7.3  關(guān)于Apache Oozie 179

第7章  MapReduce的工作機(jī)制 184

7.1  剖析MapReduce作業(yè)運(yùn)行
機(jī)制 184

7.1.1  作業(yè)的提交 185

7.1.2  作業(yè)的初始化 186

7.1.3  任務(wù)的分配 187

7.1.4  任務(wù)的執(zhí)行 188

7.1.5  進(jìn)度和狀態(tài)的更新 189

7.1.6  作業(yè)的完成 191

7.2  失敗 191

7.2.1  任務(wù)運(yùn)行失敗 191

7.2.2  application master
運(yùn)行失敗 193

7.2.3  節(jié)點(diǎn)管理器運(yùn)行失敗 193

7.2.4  資源管理器運(yùn)行失敗 194

7.3  shuffle和排序 195

7.3.1  map端 195

7.3.2  reduce端 197

7.3.3  配置調(diào)優(yōu) 199

7.4  任務(wù)的執(zhí)行 201

7.4.1  任務(wù)執(zhí)行環(huán)境 201

7.4.2  推測(cè)執(zhí)行 202

7.4.3  關(guān)于
OutputCommitters 204

第8章  MapReduce的
類型與格式 207

8.1  MapReduce的類型 207

8.1.1  默認(rèn)的MapReduce
作業(yè) 212

8.1.2  默認(rèn)的Streaming
作業(yè) 216

8.2  輸入格式 218

8.2.1  輸入分片與記錄 218

8.2.2  文本輸入 229

8.2.3  二進(jìn)制輸入 233

8.2.4  多個(gè)輸入 234

8.2.5  數(shù)據(jù)庫輸入(和輸出) 235

8.3  輸出格式 236

8.3.1  文本輸出 236

8.3.2  二進(jìn)制輸出 237

8.3.3  多個(gè)輸出 237

8.3.4  延遲輸出 242

8.3.5  數(shù)據(jù)庫輸出 242

第9章  MapReduce的特性 243

9.1  計(jì)數(shù)器 243

9.1.1  內(nèi)置計(jì)數(shù)器 243

9.1.2  用戶定義的Java
計(jì)數(shù)器 248

9.1.3  用戶定義的Streaming
計(jì)數(shù)器 251

9.2  排序 252

9.2.1  準(zhǔn)備 252

9.2.2  部分排序 253

9.2.3  全排序 255

9.2.4  輔助排序 259

9.3  連接 264

9.3.1  map端連接 266

9.3.2  reduce端連接 266

9.4  邊數(shù)據(jù)分布 270

9.4.1  利用JobConf來配置
作業(yè) 270

9.4.2  分布式緩存 270

9.5  MapReduce庫類 276

第Ⅲ部分  Hadoop的操作

第10章  構(gòu)建Hadoop集群 279

10.1  集群規(guī)范 280

10.1.1  集群規(guī)模 281

10.1.2  網(wǎng)絡(luò)拓?fù)?282

10.2  集群的構(gòu)建和安裝 284

10.2.1  安裝Java 284

10.2.2  創(chuàng)建Unix 用戶賬號(hào) 284

10.2.3  安裝Hadoop 284

10.2.4  SSH配置 285

10.2.5  配置Hadoop 286

10.2.6  格式化HDFS 文件
系統(tǒng) 286

10.2.7  啟動(dòng)和停止守護(hù)
進(jìn)程 286

10.2.8  創(chuàng)建用戶目錄 288

10.3  Hadoop配置 288

10.3.1  配置管理 289

10.3.2  環(huán)境設(shè)置 290

10.3.3  Hadoop守護(hù)進(jìn)程的
關(guān)鍵屬性 293

10.3.4  Hadoop守護(hù)進(jìn)程的
地址和端口 300

10.3.5  Hadoop的其他屬性 303

10.4  安全性 305

10.4.1  Kerberos和Hadoop 306

10.4.2  委托令牌 308

10.4.3  其他安全性改進(jìn) 309

10.5  利用基準(zhǔn)評(píng)測(cè)程序測(cè)試
Hadoop集群 311

10.5.1  Hadoop基準(zhǔn)評(píng)測(cè)
程序 311

10.5.2  用戶作業(yè) 313

第11章  管理Hadoop 314

11.1  HDFS 314

11.1.1  永久性數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 314

11.1.2  安全模式 320

11.1.3  日志審計(jì) 322

11.1.4  工具 322

11.2  監(jiān)控 327

11.2.1  日志 327

11.2.2  度量和JMX(Java
管理擴(kuò)展) 328

11.3  維護(hù) 329

11.3.1  日常管理過程 329

11.3.2  委任和解除節(jié)點(diǎn) 331

11.3.3  升級(jí) 334

第Ⅳ部分  Hadoop相關(guān)開源項(xiàng)目

第12章  關(guān)于Avro 341

12.1  Avro數(shù)據(jù)類型和模式 342

12.2  內(nèi)存中的序列化和
反序列化特定API 347

12.3  Avro數(shù)據(jù)文件 349

12.4  互操作性 351

12.4.1  Python API 351

12.4.2  Avro工具集 352

12.5  模式解析 352

12.6  排列順序 354

12.7  關(guān)于Avro MapReduce 356

12.8  使用Avro MapReduce
進(jìn)行排序 359

12.9  其他語言的Avro 362

第13章  關(guān)于Parquet 363

13.1  數(shù)據(jù)模型 364

13.2  Parquet文件格式 367

13.3  Parquet的配置 368

13.4  Parquet文件的讀/寫 369

13.4.1  Avro、Protocol Buffers
和Thrift 371

13.4.2  投影模式和讀取
模式 373

13.5  Parquet MapReduce 374

第14章  關(guān)于Flume 377

14.1  安裝Flume 378

14.2  示例 378

14.3  事務(wù)和可靠性 380

14.4  HDFS Sink 382

14.5  扇出 385

14.5.1  交付保證 386

14.5.2  復(fù)制和復(fù)用選擇器 387

14.6  通過代理層分發(fā) 387

14.7  Sink組 391

14.8  Flume與應(yīng)用程序的集成 395

14.9  組件編目 395

14.10  延伸閱讀 397

第15章  關(guān)于Sqoop 398

15.1  獲取Sqoop 398

15.2  Sqoop連接器 400

15.3  一個(gè)導(dǎo)入的例子 401

15.4  生成代碼 404

15.5  深入了解數(shù)據(jù)庫導(dǎo)入 405

15.5.1  導(dǎo)入控制 407

15.5.2  導(dǎo)入和一致性 408

15.5.3  增量導(dǎo)入 408

15.5.4  直接模式導(dǎo)入 408

15.6  使用導(dǎo)入的數(shù)據(jù) 409

15.7  導(dǎo)入大對(duì)象 412

15.8  執(zhí)行導(dǎo)出 414

15.9  深入了解導(dǎo)出功能 416

15.9.1  導(dǎo)出與事務(wù) 417

15.9.2  導(dǎo)出和SequenceFile 418

15.10  延伸閱讀 419

第16章  關(guān)于Pig 420

16.1  安裝與運(yùn)行Pig 421

16.1.1  執(zhí)行類型 422

16.1.2  運(yùn)行Pig程序 423

16.1.3  Grunt 424

16.1.4  Pig Latin編輯器 424

16.2  示例 425

16.3  與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較 428

16.4  PigLatin 429

16.4.1  結(jié)構(gòu) 430

16.4.2  語句 431

16.4.3  表達(dá)式 436

16.4.4  類型 437

16.4.5  模式 438

16.4.6  函數(shù) 443

16.4.7  宏 445

16.5  用戶自定義函數(shù) 446

16.5.1  過濾UDF 447

16.5.2  計(jì)算UDF 450

16.5.3  加載UDF 452

16.6  數(shù)據(jù)處理操作 455

16.6.1  數(shù)據(jù)的加載和存儲(chǔ) 455

16.6.2  數(shù)據(jù)的過濾 455

16.6.3  數(shù)據(jù)的分組與連接 458

16.6.4  數(shù)據(jù)的排序 463

16.6.5  數(shù)據(jù)的組合和切分 465

16.7  Pig實(shí)戰(zhàn) 465

16.7.1  并行處理 465

16.7.2  匿名關(guān)系 466

16.7.3  參數(shù)代換 467

16.8  延伸閱讀 468

第17章  關(guān)于Hive 469

17.1  安裝Hive 470

Hive的shell環(huán)境 471

17.2  示例 472

17.3  運(yùn)行Hive 473

17.3.1  配置Hive 473

17.3.2  Hive服務(wù) 476

17.3.3  Metastore 478

17.4  Hive與傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫相比 480

17.4.1  讀時(shí)模式vs.寫時(shí)
模式 480

17.4.2  更新、事務(wù)和索引 481

17.4.3  其他SQL-on-Hadoop
技術(shù) 482

17.5  HiveQL 483

17.5.1  數(shù)據(jù)類型 484

17.5.2  操作與函數(shù) 487

17.6  表 488

17.6.1  托管表和外部表 488

17.6.2  分區(qū)和桶 490

17.6.3  存儲(chǔ)格式 494

17.6.4  導(dǎo)入數(shù)據(jù) 498

17.6.5  表的修改 500

17.6.6  表的丟棄 501

17.7  查詢數(shù)據(jù) 501

17.7.1  排序和聚集 501

17.7.2  MapReduce腳本 502

17.7.3  連接 503

17.7.4  子查詢 506

17.7.5  視圖 507

17.8  用戶定義函數(shù) 508

17.8.1  寫UDF 510

17.8.2  寫UDAF 512

17.9  延伸閱讀 516

第18章  關(guān)于Crunch 517

18.1  示例 518

18.2  Crunch核心API 521

18.2.1  基本操作 522

18.2.2  類型 527

18.2.3  源和目標(biāo) 530

18.2.4  函數(shù) 532

18.2.5  物化 535

18.3  管線執(zhí)行 537

18.3.1  運(yùn)行管線 538

18.3.2  停止管線 539

18.3.3  查看Crunch計(jì)劃 540

18.3.4  迭代算法 543

18.3.5  給管線設(shè)置檢查點(diǎn) 544

18.4  Crunch庫 545

18.5  延伸閱讀 547

第19章  關(guān)于Spark 548

19.1  安裝Spark 549

19.2  示例 549

19.2.1  Spark應(yīng)用、作業(yè)、
階段和任務(wù) 551

19.2.2  Scala獨(dú)立應(yīng)用 552

19.2.3  Java示例 553

19.2.4  Python示例 554

19.3  彈性分布式數(shù)據(jù)集 555

19.3.1  創(chuàng)建 555

19.3.2  轉(zhuǎn)換和動(dòng)作 557

19.3.3  持久化 561

19.3.4  序列化 563

19.4  共享變量 564

19.4.1  廣播變量 564

19.4.2  累加器 565

19.5  剖析Spark作業(yè)運(yùn)行機(jī)制 565

19.5.1  作業(yè)提交 566

19.5.2  DAG的構(gòu)建 566

19.5.3  任務(wù)調(diào)度 569

19.5.4  任務(wù)執(zhí)行 570

19.6  執(zhí)行器和集群管理器 570

19.7  延伸閱讀 574

第20章  關(guān)于HBase 575

20.1  HBase基礎(chǔ) 575

20.2  概念 576

20.2.1  數(shù)據(jù)模型的
“旋風(fēng)之旅” 576

20.2.2  實(shí)現(xiàn) 578

20.3  安裝 581

20.4  客戶端 584

20.4.1  Java 584

20.4.2  MapReduce 588

20.4.3  REST和Thrift 589

20.5  創(chuàng)建在線查詢應(yīng)用 589

20.5.1  模式設(shè)計(jì) 590

20.5.2  加載數(shù)據(jù) 591

20.5.3  在線查詢 595

20.6  HBase和RDBMS的比較 598

20.6.1  成功的服務(wù) 599

20.6.2  HBase 600

20.7  Praxis 601

20.7.1  HDFS 601

20.7.2  用戶界面 602

20.7.3  度量 602

20.7.4  計(jì)數(shù)器 602

20.8  延伸閱讀 602

第21章  關(guān)于ZooKeeper 604

21.1  安裝和運(yùn)行ZooKeeper 605

21.2  示例 607

21.2.1  ZooKeeper中的
組成員關(guān)系 608

21.2.2  創(chuàng)建組 608

21.2.3  加入組 611

21.2.4  列出組成員 612

21.2.5  刪除組 614

21.3  ZooKeeper服務(wù) 615

21.3.1  數(shù)據(jù)模型 615

21.3.2  操作 618

21.3.3  實(shí)現(xiàn) 622

21.3.4  一致性 624

21.3.5  會(huì)話 626

21.3.6  狀態(tài) 628

21.4  使用ZooKeeper來構(gòu)建
應(yīng)用 629

21.4.1  配置服務(wù) 629

21.4.2  可復(fù)原的ZooKeeper
應(yīng)用 633

21.4.3  鎖服務(wù) 637

21.4.4  更多分布式數(shù)據(jù)
結(jié)構(gòu)和協(xié)議 639

21.5  生產(chǎn)環(huán)境中的ZooKeeper 640

21.5.1  可恢復(fù)性和性能 641

21.5.2  配置 642

21.6  延伸閱讀 643

第Ⅴ部分  案例學(xué)習(xí)

第22章  醫(yī)療公司塞納(Cerner)
的可聚合數(shù)據(jù) 647

22.1  從多CPU到語義集成 647

22.2  進(jìn)入Apache Crunch 648

22.3  建立全貌 649

22.4  集成健康醫(yī)療數(shù)據(jù) 651

22.5  框架之上的可組合性 654

22.6  下一步 655

第23章  生物數(shù)據(jù)科學(xué)：
用軟件拯救生命 657

23.1  DNA的結(jié)構(gòu) 659

23.2  遺傳密碼：將DNA字符
轉(zhuǎn)譯為蛋白質(zhì) 660

22.3  將DNA想象成源代碼 661

23.4  人類基因組計(jì)劃和參考
基因組 663

22.5  DNA測(cè)序和比對(duì) 664

23.6  ADAM，一個(gè)可擴(kuò)展的
基因組分析平臺(tái) 666

23.7  使用Avro接口描述語言進(jìn)行
自然語言編程 666

23.8  使用Parquet進(jìn)行面向列的
存取 668

23.9  一個(gè)簡(jiǎn)單例子：用Spark和
ADAM做k-mer計(jì)數(shù) 669

23.10  從個(gè)性化廣告到個(gè)性化
醫(yī)療 672

23.11  聯(lián)系我們 673

第24章  開源項(xiàng)目Cascading 674

24.1  字段、元組和管道 675

24.2  操作 678

24.3  Taps，Schemes和Flows 680

24.4  Cascading實(shí)踐應(yīng)用 681

24.5  靈活性 684

24.6  ShareThis中的Hadoop和
Cascading 685

24.7  總結(jié) 689

附錄A  安裝Apache Hadoop 691

附錄B  關(guān)于CDH 697

附錄C  準(zhǔn)備NCDC氣象數(shù)據(jù) 699

附錄D  新版和舊版Java
MapReduce API 702